在進口方面，代理報關單位應在蘇州到濟寧貨運專線領取運單和相關單據，并向檢驗檢疫局報送合同進行檢驗。檢查完成后，應向海關報關。海關根據報關具和稅單，海關將賬單退還給代理報關單位，報關單位將賬單退還給鐵路。鐵路將安排車輛更換貨物。檢驗檢疫具將在更換現場進行檢查、監督和抽樣。更換后，將票據返還給代理報關單位，代理報關單位向檢驗檢疫局出具報關單，稅單放行。鐵路收到通關放行的票據后，應當按照要求將貨物送到目的地，制定計劃。一般程序如下：經營單位與代理報關單位簽訂協議-提供相關文件和貨物：代理報關單-收到鐵路運單-檢驗檢疫局報檢-海關報關-更換鐵路-代理到檢驗檢疫局領取通關單-海關放行-鐵路編制計劃-發貨。

出口經營單位將出口貨物的相關文件提供給代理報關單位。貨物到達港口后，代理報關單位到鐵路領取運單，到檢驗檢疫局進行檢驗、檢驗、抽樣，通過檢驗檢疫到海關、海關檢驗、稅后放行、鐵路編制計劃。一般順序如下：代理人收到運單-報關-放行-鐵路發運。

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